水瘤其实是个通俗名词，医学上称为囊肿。一般而言，虽然囊肿有好几种，不过当医师告诉你是水瘤时，通指的是内容物全是清淡的液体。至于俗称月经瘤或巧克力囊肿的子宫内膜异位瘤、发炎引起的输卵管卵巢脓疡，以及内有实心部分的肿瘤，通常不被称为水瘤。
水瘤大部分是良性的，尤其体积小的，不但是良性，也不必日夜担心它会恶化，因此一般对于直径五、六公分以内的，大都主张不必动刀，不过必须确定囊肿内全是液体，没有实心的部分，才能放心。但如水瘤发生在停经后两年以上，则需另做考虑，因为停经后不再排卵，理论上不会再出现功能性囊肿。
产生水瘤的原因，视其种类而定，像功能性囊肿，例如滤泡囊肿和黄体囊肿，都跟荷尔蒙的分泌有关。卵巢在正常月经週期接近排卵日时，原本就会出现卵泡，一般在大到两公分以上才排卵，偶尔也有长到三公分大的，看来就像个囊肿。即使排卵之后，也会形成一个黄体，照样可大到三、四公分，甚至也有五公分以上的。
这些卵泡或是所谓功能性的囊肿，即滤泡瘤或黄体瘤，往往不但是良性，而且多在下次月经来过即消失，所以再照超音波，可能就变成没有水瘤了。另外，一些真正的卵巢赘生瘤，例如卵巢上皮细胞生出的囊状腺瘤，以及单纯囊肿，则与恶性肿瘤一般，真正形成原因未明。
